Prova in questo modo:
<div id="header">
<a href="ht tp://ww w.sito/">
<object classid="clsid:D27CDB6E-AE6D-11cf-96B8-444553540000"
codebase="http://download.macromedia.com/pub/shockwave/cabs/flash/swflash.cab#version=6,0,40,0"
width="550" height="400" id="myMovieName">
<param name="movie" value="myFlashMovie.swf">
<param name="quality" value="high">
<param name="bgcolor" value="#FFFFFF">
<embed src="myFlashMovie.swf"
quality="high" bgcolor="#FFFFFF" width="550" height="400"
name="myMovieName" align="" type="application/x-shockwave-flash"
pluginspage="http://www.macromedia.com/go/getflashplayer"></embed>
</object>
</a>
</div>
A questo punto puoi eliminare la definizione CSS per #header a span.
Per mantenere il click sull'animazione Flash che indirizza ad un URL, come lo era in precedenza per l'immagine, con tutta probabilità dovrai implementare la funzione ActionScript getURL direttamente nell'animazione Flash.